Bressa, C.González-Soltero, R.Tabone, M.Clemente-Velasco, S.Gálvez, B. G.Larrosa, M.2025-11-212025-11-212025-12Bressa, C, González-Soltero, R, Tabone, M, Clemente-Velasco, S, Gálvez, B G & Larrosa, M 2025, 'Exploring the relationship between APOEε4 allele and gut microbiota composition and function in healthy adults', AMB Express, vol. 15, no. 1, 77. https://doi.org/10.1186/s13568-025-01888-42191-0855PubMedCentral: PMC12081816unpaywall: 10.1186/s13568-025-01888-4https://hdl.handle.net/10641/6510Publisher Copyright: © The Author(s) 2025.El alelo APOE ε4 (APOE4) es un factor de riesgo conocido para enfermedades neurodegenerativas y cardiovasculares, pero su relación con la composición corporal y el metabolismo sigue siendo objeto de debate. La microbiota intestinal influye en el metabolismo y la inmunidad del huésped, aunque su relación con el genotipo APOE en individuos sanos no se comprende bien. El objetivo de este trabajo fue examinar las asociaciones entre el genotipo APOE y la composición y función de la microbiota intestinal en adultos sanos, centrándose en las diferencias microbianas y metabólicas relacionadas con el alelo APOE4. Se genotipó el APOE de setenta y siete adultos españoles sanos. Los perfiles de la microbiota fecal se evaluaron mediante secuenciación del gen ARNr 16S, y las funciones predichas se infirieron mediante PICRUSt2. También se midieron la composición corporal (DEXA) y la actividad física (acelerometría). Los portadores de APOE4 presentaron cambios sutiles en la composición de la microbiota, incluyendo una reducción de cinco veces en Megamonas y una menor abundancia del grupo Eubacterium brachy —ambos relacionados con la obtención de energía y la adiposidad— en comparación con los homocigotos para APOE3. Un género no caracterizado de Puniceicoccaceae estaba enriquecido en los portadores de APOE4. Aunque la abundancia del grupo E. brachy se correlacionó con la adiposidad, no se observaron diferencias significativas en la composición corporal. Las predicciones funcionales mostraron que la microbiota asociada a APOE4 estaba enriquecida en vías de biosíntesis de carotenoides y metabolismo de la trehalosa, y presentaba una disminución en la biosíntesis de triptófano, la producción de propionato y los mecanismos de resistencia a múltiples fármacos. Los portadores de APOE4 albergan una microbiota intestinal con características taxonómicas y funcionales distintivas, que podrían reflejar adaptaciones a desafíos metabólicos y oxidativos. Estos hallazgos subrayan la relevancia del microbioma intestinal en la configuración de los fenotipos asociados a APOE4 y justifican una mayor investigación sobre sus contribuciones mecanísticas a la salud y la enfermedad. [Traducción automática al español; idioma original: inglés.]The APOE ε4 allele (APOE4) is a known risk factor for neurodegenerative and cardiovascular diseases, but its link to body composition and metabolism remains debated. The gut microbiota influences host metabolism and immunity, yet its relationship with APOE genotype in healthy individuals is not well understood. The objective of this work was to examine associations between APOE genotype and gut microbiota composition and function in healthy adults, focusing on microbial and metabolic differences related to the APOE4 allele. Seventy-seven healthy Spanish adults were genotyped for APOE. Fecal microbiota profiles were assessed by 16 S rRNA gene sequencing, and predicted functions were inferred using PICRUSt2. Body composition (DEXA) and physical activity (accelerometry) were also measured. APOE4 carriers exhibited subtle shifts in microbiota composition, including a five-fold reduction in Megamonas and lower abundance of the Eubacterium brachy group—both linked to energy harvest and adiposity—compared to APOE3 homozygotes. An uncharacterized Puniceicoccaceae genus was enriched in APOE4 carriers. Although E. brachy group abundance correlated with adiposity, no significant differences in body composition were observed. Functional predictions showed APOE4-associated microbiota enriched in pathways for carotenoid biosynthesis and trehalose metabolism, and depleted in tryptophan biosynthesis, propionate production, and multidrug resistance mechanisms. APOE4 carriers harbor gut microbiota with distinct taxonomic and functional features, potentially reflecting adaptations to metabolic and oxidative challenges. These findings underscore the relevance of the gut microbiome in shaping APOE4-associated phenotypes and warrant further investigation into its mechanistic contributions to health and disease.1461010enghttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/APOEε4 alleleBody compositionGut microbiotaHealthy adultsMetabolic functionBiophysicsApplied Microbiology and BiotechnologySDG 3 - Good Health and Well-beingJournal ArticleYesyesjournal articleopen access10.1186/s13568-025-01888-4https://www.scopus.com/pages/publications/105005274800https://www.scopus.com/pages/publications/105005274800#tab=citedBy